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使用R语言进行生存分析及状态的注意事项
2023-09-29 14:34  浏览:1587  搜索引擎搜索“早勤网”
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探序基因肿瘤研究院整理


R包survival可进行生存分析,并绘制生存曲线

install.packages("survival") 

library(survival)

survival包的详细信息:https://cran.r-project.org/web/packages/survival/index.html


1. 生存时间的定义

2. 病人删失的处理

3. 注意病人状态的表示,根据survival包的说明书,bladder数据集表格,status指的是End of interval code, 0=censored, 1=recurrence,2=death from bladder disease, 3=death other/unknown cause。

4. survival包中的Surv函数,接受时间变量和事件状态变量两个参数。根据说明书描述, event这个参数:

The status indicator, normally 0=alive, 1=dead. Other choices are TRUE/FALSE (TRUE = death) or 1/2 (2=death). For interval censored data, the status indicator is 0=right censored, 1=event at time, 2=left censored, 3=interval censored. For multiple endpoint data the event variable will be a factor, whose first level is treated as censoring. Although unusual, the event indicator can be omitted, in which case all subjects are assumed to have an event.

下载各种数据集的临床信息,大家要注意对应好病人状态

参考:

知乎-统计基本功:一文搞懂生存分析

CSDN-使用R语言中的survival包可以进行生存分析,并生成生存曲线

CSDN-使用R语言中的survival包进行生存分析是一种常见的统计方法

发布人:6250****    IP:117.173.23.***     举报/删稿
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